Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1EQ9GZS1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms