Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AMBRA1Q9C0C7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms