Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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