Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms