Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIFKQ9BYG3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIFKQ9BYG3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms