Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF17Q9BXT8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms