Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC2P3Q9BVR0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC2P3Q9BVR0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC2P3Q9BVR0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC2P3Q9BVR0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC2P3Q9BVR0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC2P3Q9BVR0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERC2P3Q9BVR0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERC2P3Q9BVR0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms