Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms