Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFJQ9BTM1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFJQ9BTM1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms