Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms