Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms