Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms