Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP8Q99708 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms