Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NAP1L3Q99457 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms