Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms