Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC136Q96JN2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms