Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms