Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms