Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKD1Q969G9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms