Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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GTF3C6Q969F1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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GTF3C6Q969F1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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GTF3C6Q969F1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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GTF3C6Q969F1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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GTF3C6Q969F1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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GTF3C6Q969F1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
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GTF3C6Q969F1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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GTF3C6Q969F1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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GTF3C6Q969F1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3C6Q969F1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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