Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C17orf47Q8NEP4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms