Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF1Q8N6C5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF1Q8N6C5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms