Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROM2Q8N271 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms