Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLD3Q8IV08 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms