Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDXQ7Z353 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms