Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTF1AQ7RTS3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms