Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS1

BHLHA15, Class A basic helix-loop-helix protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA15Q7RTS1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA15Q7RTS1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms