Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms