Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PREX2Q70Z35 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PREX2Q70Z35 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms