Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
FGD6Q6ZV73 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD6Q6ZV73 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms