Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRIG3Q6UXM1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms