Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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