Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OPN5Q6U736 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms