Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC4Q6P2E9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms