Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
REEP3Q6NUK4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REEP3Q6NUK4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms