Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
INTS3Q68E01 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms