Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms