Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms