Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SAPCD1Q5SSQ6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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