Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRMS1LQ5PSV4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRMS1LQ5PSV4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms