Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF628Q5EBL2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF628Q5EBL2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF628Q5EBL2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms