Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms