Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESCO2Q56NI9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms