Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms