Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA8Q53HL2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms