Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q499Y3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q499Y3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q499Y3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q499Y3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Q499Y3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q499Y3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q499Y3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q499Y3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q499Y3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q499Y3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q499Y3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q499Y3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q499Y3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q499Y3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q499Y3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q499Y3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q499Y3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q499Y3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q499Y3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q499Y3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q499Y3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q499Y3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q499Y3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q499Y3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q499Y3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q499Y3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms