Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TTLL9Q3SXZ7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms