Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms