Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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