Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP41Q3LFD5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP41Q3LFD5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms